Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UPC7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UPC7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms