Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms