Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LchnQ3UHG7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms