Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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