Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q3U595 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q3U595 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U595 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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