Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms