Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms