Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms