Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms