Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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