Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw18Q3TSA9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms