Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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