Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3KNL4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3KNL4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3KNL4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3KNL4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3KNL4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3KNL4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3KNL4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3KNL4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms