Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms