Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim71Q1PSW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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