Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300lgQ1ERP8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms