Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ptchd1Q14B62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ptchd1Q14B62 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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