Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lingo4Q149C3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lingo4Q149C3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lingo4Q149C3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lingo4Q149C3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Lingo4Q149C3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lingo4Q149C3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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