Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39dQ0VF76 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms