Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms