Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms