Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab42Q0PD08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms