Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps8Q0P5W1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms