Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc45a4Q0P5V9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc45a4Q0P5V9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms