Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms