Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms