Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms