Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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