Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Siah2Q06986 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms