Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms