Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrx2Q06348 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms