Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox9Q04887 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms