Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms