Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nf1Q04690 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nf1Q04690 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms