Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms