Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aplp1Q03157 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Aplp1Q03157 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms