Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col6a2Q02788 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col6a2Q02788 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms