Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms