Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms