Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms