Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms