Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms