Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp1Q01514 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp1Q01514 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms