Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2aQ01320 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms