Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2bQ01097 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2bQ01097 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms