Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms