Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms