Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms