Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8a1Q00558 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms