Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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